1958 年成立秭归县科学技术委员会， 2001 年机构改革，机构设置为科学技术局。领导职数 3 个，行政编制 7 个，事业编制 2 个，内设 4 个职能股室。机关现有在职在编干部职工 9 人。
多年来，科技局始终坚持“有所为，有所不为”和“创新、产业化”的方针，突出县域经济结构调整，围绕难点、热点和关键性技术，加强集成，开展科技攻关、试验、示范，有力地推进了县域经济的发展，促进了科技进步。 农业科技进步贡献率 47.4% ，工业科技进步贡献率 39.6% ，科技进步对整个经济增长的贡献率 41.48% 。
近几年来，实施了一大批国家、省、市重点科技项目，如“长红脐橙示范县工程”、“紫色岩坡地改良与利用研究及示范”、“三峡库区柑桔品种改良和高效生态桔园模式研究与示范”、“纽荷尔脐橙示范村工程”、“生态农业工程模式研究与示范”、“桃叶橙提纯与复壮”、“水泥厂 14 项综合节能技术”、“再生纸脱墨制浆技术”、“LED 发光二级管支架生产技术”、“石油焦代替木炭冶炼金属硅技术” 等。
  柑桔产业：先后开展了柑桔品种选育、早果丰产栽培技术、病虫害防治、配方施肥、生态模式等 30 多个技术课题的研究与示范，已建成彭家坡、两面山、牌楼、王家岭、郑家岭 等优质脐橙示范园，拥有以脐橙、夏橙、桃叶橙和桔橙为特色的 80 多个品种（系）资源，调整了柑桔的品种结构，延长了柑桔鲜果供应期， 全县柑 桔 品质普遍提高，优质品率达到 70% 以上， 脐橙 品质达到“ AAA ”标准，并获得绿色证书， 秭归 脐橙获“中华名果”称号，全县柑桔发展到12.5万亩，其中优质 脐橙 10 万亩，柑 桔 产业已成为名副其实的大产业 ；实施“中山果业开发”项目，制定了《中山果业开发规划》，中山开发进程加快，名优特果业开发出现良好的发展态势，引进名优品种，规范建立母本园、采穗圃、苗圃和示范园， 全县核桃新品种达到了 11 个，李子新品种达到了 17 个，以白花桃、脆蜜桃为主要品种的桃子栽培试验、示范以及石榴、枣、梨的管理工作顺利开展，基地建设稳固。 银杏、板栗、茶叶、烤烟、蔬菜、魔芋、马铃薯、黄姜等产业开展了相应的技术推广、培训和科技攻关，建立了高标准的现代化示范园，有的还建立了龙头加工企业，如无性系繁殖、喷灌设施配套的生态茶叶示范，富峰、奥海魔芋加工、枳实加工等；水体开发以科研为先导，着手开展种繁基地建设、引种驯化、种繁试验、人才引进和技术培训工作，创办了“三峡库区名优水产种繁养殖试验示范基地”，并与华中农业大学水产学院建立了技术合作关系。此外，还开展了人参、西洋参的栽培试验工作，并取得了良好的进展；工业上，大力开展技术创新 ，积极推广应用高新技术，使一批骨干企业的一系列技术问题得到解决，涌现了一批科技兴企的典型。开发出了 LED 引线支架、华扬太阳能热水器、医用铝塑组合盖等高新技术产品，匡通公司被市政府认定为市级高新技术企业。 高新技术产业增加值在工业经济增加值中占有了一定比例。
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